基于海水样本,研究人员发现大量新病毒,且具有多样性,以至于研究人员提出将RNA病毒所需的分类群数量增加一倍,从现有的5个门分类增加至10个门分类。据悉,门分类是生物学中一个宽泛的分类概念,在界分类之下。
微生物学家发现海洋中有大量多样性新病毒,甚至发现一个完整的门分类病毒——Taraviricota,它们分布在全球所有海域,这表明它们在海洋生态中具有重要意义。
对RNA病毒的研究通常集中在那些引起疾病的病毒上(人们熟知的RNA包括:流感病毒、埃博拉病毒和新冠病毒等),然而它们仅是地球RNA病毒中的“冰山一角”,目前我们想在非常大的范围内系统地研究海洋病毒,探索一个之前未曾探索的新领域,揭晓更多的海洋病毒谜团。
该项研究报告发表在4月7日出版的《科学》杂志上,研究人员分析了来自世界五大洋中121个区域的35000份海洋样本。研究人员称,他们检测了从浮游生物中提取的基因序列,浮游生物是RNA病毒的常见宿主。通过寻找一种叫做RdRp的古老基因,他们锁定了属于RNA病毒的序列。RdRp存在于所有RNA病毒中,但其他病毒和细胞中并不存在,最终他们鉴定发现超过44000条含有该基因的病毒序列。
但是RdRp基因已有数十亿年历史,且进化了许多次,由于该基因的进化可追溯至很久以前,研究人员很难确定基因序列之间的进化关系,因此,研究人员使用机器学习来帮助组织它们。
总体而言,他们确定了大约5500种新RNA病毒,它们分别属于5个现有门分类,以及5个新提出的门分类,研究人员将分别命名为:Taraviricota、Pomiviricota、paraxenviricota、Wamoviricota和Arctiviricota。其中Taraviricota门病毒种类分布在温带和热带水域特别多,而Arctiviricota门病毒集中分布在北冰洋海域。
理解RdRp基因是如何随着时间变迁而逐渐进化,有助于洞察地球上早期生命是如何完成进化的,RdRp基因被认为是最古老的生物基因之一,它在生物体需要DNA之前就已存在,因此我们不仅是追踪分析病毒的起源,也是在追踪生命的起源!